MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10

Total Repeats: 691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017424	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387827799
2	NC_017424	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387827799
3	NC_017424	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387827799
4	NC_017424	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827799
5	NC_017424	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827799
6	NC_017424	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
7	NC_017424	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827799
8	NC_017424	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827799
9	NC_017424	AAT	2	6	459	464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
10	NC_017424	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387827799
11	NC_017424	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387827799
12	NC_017424	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827799
13	NC_017424	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387827799
14	NC_017424	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827799
15	NC_017424	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827799
16	NC_017424	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827799
17	NC_017424	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
18	NC_017424	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827799
19	NC_017424	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	387827799
20	NC_017424	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
21	NC_017424	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
22	NC_017424	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827799
23	NC_017424	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	387827799
24	NC_017424	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827799
25	NC_017424	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
26	NC_017424	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827799
27	NC_017424	AGT	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827799
28	NC_017424	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
29	NC_017424	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827799
30	NC_017424	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
31	NC_017424	ATA	2	6	2025	2030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827800
32	NC_017424	TAG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827800
33	NC_017424	AAC	2	6	2255	2260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827800
34	NC_017424	TGG	3	9	2279	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827800
35	NC_017424	GT	3	6	2304	2309	0 %	50 %	50 %	0 %	387827800
36	NC_017424	AAAG	2	8	2384	2391	75 %	0 %	25 %	0 %	387827800
37	NC_017424	TAAAT	2	10	2420	2429	60 %	40 %	0 %	0 %	387827800
38	NC_017424	CA	3	6	2503	2508	50 %	0 %	0 %	50 %	387827800
39	NC_017424	ATTT	2	8	2521	2528	25 %	75 %	0 %	0 %	387827800
40	NC_017424	TGCT	2	8	2533	2540	0 %	50 %	25 %	25 %	387827800
41	NC_017424	TAA	2	6	2571	2576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827800
42	NC_017424	GCT	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827801
43	NC_017424	GCAA	2	8	2681	2688	50 %	0 %	25 %	25 %	387827801
44	NC_017424	TGA	2	6	2744	2749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827801
45	NC_017424	GTT	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827801
46	NC_017424	TA	3	6	2969	2974	50 %	50 %	0 %	0 %	387827801
47	NC_017424	CTGATA	2	12	2989	3000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827801
48	NC_017424	ATGT	2	8	3019	3026	25 %	50 %	25 %	0 %	387827801
49	NC_017424	GTAT	2	8	3044	3051	25 %	50 %	25 %	0 %	387827801
50	NC_017424	ATAA	2	8	3126	3133	75 %	25 %	0 %	0 %	387827801
51	NC_017424	TTA	2	6	3142	3147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827801
52	NC_017424	CCA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827801
53	NC_017424	AT	3	6	3183	3188	50 %	50 %	0 %	0 %	387827801
54	NC_017424	CAAT	2	8	3208	3215	50 %	25 %	0 %	25 %	387827801
55	NC_017424	GGT	2	6	3336	3341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827801
56	NC_017424	TAAA	2	8	3367	3374	75 %	25 %	0 %	0 %	387827802
57	NC_017424	ATT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827802
58	NC_017424	AAG	2	6	3415	3420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827802
59	NC_017424	TGA	2	6	3478	3483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827802
60	NC_017424	T	6	6	3506	3511	0 %	100 %	0 %	0 %	387827802
61	NC_017424	ATC	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827802
62	NC_017424	TGG	2	6	3652	3657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827802
63	NC_017424	CTA	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827802
64	NC_017424	AAT	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827802
65	NC_017424	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827802
66	NC_017424	TTTA	2	8	3894	3901	25 %	75 %	0 %	0 %	387827802
67	NC_017424	TAA	2	6	3944	3949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827802
68	NC_017424	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
69	NC_017424	TGA	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
70	NC_017424	ATT	2	6	3987	3992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
71	NC_017424	TAT	2	6	4036	4041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
72	NC_017424	A	6	6	4098	4103	100 %	0 %	0 %	0 %	387827803
73	NC_017424	ACA	2	6	4139	4144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827803
74	NC_017424	ATT	2	6	4206	4211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
75	NC_017424	AT	3	6	4276	4281	50 %	50 %	0 %	0 %	387827803
76	NC_017424	TAA	3	9	4291	4299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827803
77	NC_017424	AGT	2	6	4334	4339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
78	NC_017424	TTA	2	6	4353	4358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
79	NC_017424	ACT	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827803
80	NC_017424	AGA	2	6	4465	4470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827803
81	NC_017424	GATAAA	2	12	4484	4495	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827803
82	NC_017424	A	6	6	4512	4517	100 %	0 %	0 %	0 %	387827803
83	NC_017424	CGA	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827803
84	NC_017424	GAT	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
85	NC_017424	GCA	3	9	4619	4627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827803
86	NC_017424	AGT	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
87	NC_017424	TAA	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827803
88	NC_017424	AGA	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827803
89	NC_017424	TTA	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
90	NC_017424	AGTA	2	8	4787	4794	50 %	25 %	25 %	0 %	387827803
91	NC_017424	CTAC	2	8	4799	4806	25 %	25 %	0 %	50 %	387827803
92	NC_017424	TCAT	2	8	4846	4853	25 %	50 %	0 %	25 %	387827803
93	NC_017424	GGT	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827803
94	NC_017424	CTA	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827803
95	NC_017424	GAA	2	6	4986	4991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827804
96	NC_017424	TACT	2	8	5155	5162	25 %	50 %	0 %	25 %	387827804
97	NC_017424	GTT	2	6	5199	5204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827804
98	NC_017424	GAATTT	2	12	5208	5219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387827804
99	NC_017424	A	6	6	5229	5234	100 %	0 %	0 %	0 %	387827804
100	NC_017424	TGAACT	2	12	5246	5257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827804
101	NC_017424	ATT	2	6	5260	5265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827804
102	NC_017424	TAG	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827804
103	NC_017424	GAA	2	6	5286	5291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827804
104	NC_017424	GGC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827804
105	NC_017424	G	6	6	5300	5305	0 %	0 %	100 %	0 %	387827804
106	NC_017424	TG	3	6	5385	5390	0 %	50 %	50 %	0 %	387827804
107	NC_017424	AATG	2	8	5401	5408	50 %	25 %	25 %	0 %	387827804
108	NC_017424	TGT	2	6	5494	5499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827805
109	NC_017424	TTC	2	6	5515	5520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827805
110	NC_017424	AG	3	6	5526	5531	50 %	0 %	50 %	0 %	387827805
111	NC_017424	TTA	2	6	5568	5573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827805
112	NC_017424	ATTTA	2	10	5700	5709	40 %	60 %	0 %	0 %	387827805
113	NC_017424	TGG	2	6	5817	5822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827806
114	NC_017424	AT	3	6	5919	5924	50 %	50 %	0 %	0 %	387827806
115	NC_017424	AAT	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827806
116	NC_017424	TA	3	6	5935	5940	50 %	50 %	0 %	0 %	387827806
117	NC_017424	TAT	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827806
118	NC_017424	AAGT	2	8	6066	6073	50 %	25 %	25 %	0 %	387827806
119	NC_017424	GTA	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827806
120	NC_017424	GCA	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827806
121	NC_017424	TTG	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827806
122	NC_017424	AAT	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827807
123	NC_017424	GCT	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827807
124	NC_017424	ATA	2	6	6309	6314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827807
125	NC_017424	AT	4	8	6411	6418	50 %	50 %	0 %	0 %	387827807
126	NC_017424	ATA	2	6	6502	6507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827807
127	NC_017424	AT	3	6	6548	6553	50 %	50 %	0 %	0 %	387827807
128	NC_017424	AATT	2	8	6560	6567	50 %	50 %	0 %	0 %	387827807
129	NC_017424	TAAT	2	8	6607	6614	50 %	50 %	0 %	0 %	387827807
130	NC_017424	AGG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827807
131	NC_017424	TAG	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827808
132	NC_017424	ATT	2	6	6770	6775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
133	NC_017424	TAA	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827808
134	NC_017424	TGC	2	6	6825	6830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827808
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136	NC_017424	GAAAA	2	10	6923	6932	80 %	0 %	20 %	0 %	387827808
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